La Comisión estaba dedicada a promocionar y defender los derechos de los niños, adolescentes y jóvenes; investigar, realizar campañas y preparar jornadas. Impulsó el programa Prevenir (Prevención de la violencia policial e institucional en niños y jóvenes) como respuesta a innumerables consultas y quejas recibidas con motivo de la violencia que se ejerce desde las instituciones sobre los niños y adolescentes. Tenía una guardia para la recepción de denuncias y realizaba talleres de prevención y seminarios de formación. También llevó adelante el proyecto Patrocinio Joven. Estuvo a cargo de Lucía Alberti.